1. 排名上，這兩學校都排在QS前50，其中香港科技大學在第34，香港中文大學排在第39。THE排名中，港中文第49，港科66，港科排在港中文之前。ARWU排名中，港中文排在第101-150之間，港科則排在第201-300。US NEWS排名中，港中文82，港科105。
整體來看的話，科大和港中文有時港科在前，有時港中文在前，總體上差別不大。

2. 專業上，香港科技大學的會計與金融排在世界第22，其他土木、材料、電子工程等都是世界前20的；港中文比較出彩的主要是傳媒（第11）、哲學（第28）、語言學（第36）等文社科。
整體來看，科大的商科比較突出，香港科技大學更偏向理工科，香港中文大學更偏向文社科。

3. 申請難度上，都不簡單，但也都有一些些微的差別。拿商科來說，科大則比較偏好985/211的學生；港中文商學院強制要求提交GMAT，對于實習經歷也比較看重。