揚州大學的研究生教育開始于上世紀60年代初，是國務院批準的首批博士、碩士學位授予權單位。學校現有一級學科博士學位授權點11個，一級學科碩士學位授權點44個。博士專業學位類別1個，碩士專業學位類別15個。擁有國家級重點學科2個，國家重點（培育）學科1個，農業部重點學科1個，省優勢學科5個，省重點序列學科1個，省一級學科重點學科6個，校一級學科重點學科33個。博、碩士生導師（含校外導師）2400多人。在籍各類博、碩士研究生過萬人，已經形成了學術學位、專業學位特色各異、協調發展的培養格局。
　　揚州大學始終以服務需求、提高質量為主線，堅持“改革、建設和管理”三位一體的原則，按照“完善制度、提高質量、科教結合、支撐創新、適應需求、引領未來”的思路，以構建和完善研究教育與管理制度體系建設為抓手，以成功召開學校合并辦學以來的首次研究生教育工作會議為契機，全面深化綜合改革，著力完善“三型一化”培養模式，大力推進內涵式發展，切實提高研究生教育質量。
　　在研究生招生方面，推進研究生招生改革，動態管理招生計劃，分類確定博士生錄取要求，不斷加大復試環節選拔力度。研究生生源質量得到改善，招生人數和培養規模創歷史新高。非全日制研究生招生綜合排序列全國招生單位前列。揚州大學連年被評為“江蘇省優秀研究生招生單位”和“江蘇省優秀研究生報考點”雙優單位。
　　在研究生培養方面，2014年學校提出積極構建、完善以提高創新能力為目標的學術型研究生、以提升能力為導向的專業型研究生、兩者兼具的復合型研究生以及國際化研究生的分類培養模式。《江蘇教育報》對此作了專題報道，江蘇教育網、江蘇省學位與研究生教育網站都進行了轉載。學校抓住機遇，大力發展專業學位研究生教育，推進與完善校、教育中心、專業領域三級管理體制，重視專業學位研究生實踐教學，完善專業學位論文與學術學位論文分類評閱制度，設立“專業學位碩士研究生示范論文”評審項目。推進專業學位研究生教學案例庫建設，設立“優秀教學案例庫”評審項目。加強研究生工作站內涵建設與管理，建有省研究生工作站200多個，6個研究生工作站被評為首批省優秀研究生工作站。學校積極推進研究生培養國際化，不斷加強研究生國際交流合作能力培養。先后與法國巴斯德研究所、日本九洲工業大學等機構，通過學分互認、學位互授等方式，聯合培養博士、碩士研究生。學校設立博士生國際學術會議交流專項基金，引進全英文授課課程，加入國家建設高水平大學公派研究生聯合培養博碩士研究生項目、創新型人才國際合作培養項目，研究生培養國際化進程進一步加快。學校始終圍繞研究生培養質量這一核心，堅持分類培養，加強省“研究生培養創新工程”項目的申報與過程管理，設立優秀博士學位論文基金和全國優秀博士學位論文作者專項配套資金，加大學位論文抽檢力度，嚴把出口關，促進創新人才培養和高水平科研成果的產生。4篇論文獲全國優秀博士學位論文，6篇論文獲全國優秀博士學位論文提名論文。
　　揚州大學始終以立德樹人為根本任務，牢固樹立“育人為本、德育為先”的理念，堅持黨委統一領導、黨政齊抓共管、專兼職隊伍齊心協力、校院通力合作，構建了科學、完備的研究生思想政治教育領導體制和工作機制。實施研本“1+1”引領計劃，引導研究生增強自我教育、自我管理、自我服務能力，形成了研本互動式思想政治教育與管理的新模式。加強研究生思想政治教育和科學道德教育，加強心理健康教育和安全教育，研究生社會責任感明顯增強。
　　學校積極組織開展研究生學術文化活動，社會實踐與學風建設活動精彩紛呈。注重搭建研究生學術文化平臺，豐富校、院學術交流載體，校研究生學術文化節、博雅大講堂和各學院專業論壇等活動豐富多彩，多次承辦全省博士論壇和長三角研究生論壇，為廣大研究生增進學術交流、拓展學術視野、展示學術能力提供了重要舞臺。
　　研究生培養的支持保障體系更加完備，形成了以高水平科研成果為導向的國家獎學金評審工作體系，建立以科研項目為引領、以導師為主體的助研資助體系。研究生教育經費投入不斷增加，學業獎學金覆蓋面100%，獎勵標準處于全省領先水平，極大地改善了研究生待遇。研究生國家獎學金評定工作規范，在全校范圍內統籌使用博士生和部分碩士生國家獎學金指標，激發了研究生學習和創新的積極性與主動性。
　　研究生就業指導工作務實推進。認真開展研究生職業認知和職業生涯規劃教育、就業技巧指導、創業教育等活動，深入實施就業幫扶計劃，經常舉辦普適性指導、個性化咨詢等服務，研究生就業創業能力不斷提高，就業率逐年攀高，就業質量穩步提升。
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