目前，各大院校與中醫醫史文獻專業相關的研究方向都略有不同的側重點。
　　以山東中醫藥大學為例，該學科的研究方向有：
　　01中醫臨床疾病史研究
　　02經典醫籍文獻研究
　　03中醫臨床文獻研究
　　04歷代醫家臨床學說研究
　　05中醫醫案研究
　　06中醫藥文化研究
　　07中醫藥文獻數字化研究
　　08中醫食療與營養文獻研究