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學科建設
據2018年6月學院網站信息顯示,杭州醫學院共有浙江省一流學科(B類)建設項目4個,浙江省醫學重點學科12個,浙江省醫學重點建設學科(扶植)1個。
浙江省一流學科(B類)建設項目:臨床醫學、基礎醫學、公共衛生與預防醫學、藥學 
浙江省醫學重點建設學科(扶植):臨床病理學
教學建設
質量工程
截至2018年5月,杭州醫學院共建有中央財政支持的重點建設專業(高職高專)2個,省級重點專業(高職高專)1個,省級特色專業(高職高專)5個,省級優勢專業(高職高專)2個;中央財政支持實訓基地(高職高專)3個,省級示范性實訓基地(高職高專)3個;有國家級精品課程(高職高專)1門,國家級精品資源共享課程(高職高專)1門,省級精品課程(高職高專)11門;獲高等教育國家級教學成果二等獎1項。
中央財政支持的重點建設專業(高職高專):藥學、醫學檢驗技術 

省級重點專業(高職高專):醫學影像技術
省級特色專業(高職高專):臨床醫學、藥學、醫學檢驗技術、護理、醫學影像技術 
省級優勢專業(高職高專):臨床醫學、藥學 
中央財政支持實訓基地(高職高專):臨床技能實訓基地、護理技能實踐基地、醫學影像實訓中心
省級示范性實訓基地(高職高專):醫學形態實訓基地、藥學綜合實訓基地、基層公共衛生實訓基地 
國家級精品課程(高職高專):藥理學

國家級精品資源共享課程(高職高專):藥理學
省級精品課程(高職高專):內科學、藥理學、病理學與病理生理學、藥物化學、藥物分析、實用生物化學、藥學微生物及技術、天然藥物學實用技術、臨床實用生理學、衛生法規與監督實務、內科護理學 
國家級教學成果二等獎:《鄉村醫生連續統一體培養模式的探索與實踐》教學研究項目(2005年)
附屬醫院
截至2018年5月,杭州醫學院共有三級甲等直屬附屬醫院1家,非直屬附屬醫院5家,教學醫院61家,教學基地74個。
三級甲等直屬附屬醫院:浙江省人民醫院
三級乙等直屬附屬醫院:杭州市臨安區人民醫院

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