我校自創建以來，雖與西醫院校幾度分合，但中醫藥研究生教育一直持續發展。分別于1983年及1999年招收第一屆碩士、博士研究生。2013年，學校恢復獨立設置后成立研究生學院。目前，我校擁有中醫學、中西醫結合2個博士一級學科學位授權點與中醫博士專業學位授權類別，中醫學、中西醫結合、中藥學3個碩士一級學科學位授權點與中醫、中藥學、護理3個碩士專業學位授權類別，共涵蓋博士學位授權點（二級學科或授權領域）24個、碩士學位授權點（二級學科或授權領域）28個。擁有一支高水平的研究生師資隊伍，其中博士生導師55人，碩士生導師416人。現有在校研究生1124人，其中博士生138人，碩士生986人。現有校內招生二級單位5個，中醫專碩研究生住院醫師規范化培訓基地4個，省級專業學位研究生培養實踐基地5個，校級基地11個。

研究生學院建有獨立的黨總支。學院下設招生、行政、黨務、學籍、培養、學位等多個崗位。學院始終堅持以立德樹人為根本，以創新及實踐能力培養為核心，尊重學生個性發展，全方位提高研究生綜合素養，努力為社會培養優秀的中醫藥高層次人才。