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植物學（071001） 以秦巴山區及周邊地區的資源植物、珍稀瀕危保護植物為研究對象，運用現代生物學技術開展植物資源綜合研究。培養具有植物資源應用基礎研究、藥用植物與天然次生代謝產物研究等領域的知識與技能，具有創新精神，能獨立從事科學研究、教學與相關管理工作的高級專門人才。
研究方向一：植物資源學 以秦巴山區豐富的植物資源為研究對象，以生物技術為主要研究手段，開展珍稀瀕危保護植物、藥用植物和特種經濟植物的種質資源保護與應用基礎研究。
研究方向二：植物生物技術 利用現代生物技術與手段，開展地道藥材、秦巴山區特有植物資源和保護植物試管微體繁殖、中藥指紋圖譜和植物分子生物學研究。
研究方向三：植物天然產物研究 利用現代生物技術與工程方法，開展資源植物品質分析，次生代謝產物提取、分離、純化與活性成分開發利用基礎研究。
研究方向四：植物分子生態學  以秦巴山區特殊地理環境所孕育的獨特生態環境和豐富植物資源為研究對象，積極開展秦巴山區珍稀特有植物的保護生物學、傳粉生物學研究，開展秦巴山區生態環境保護及其自然資源保護與開發生物技術研究。形成以植物保護生物學研究為主的研究特色。