臨床獸醫學，為學科為國家重點學科，臨床獸醫學博士、碩士授予點。由獸醫內科學和診斷學、獸醫外科學和產科學、中獸醫學和動物醫院等4個三級學科組成。其中獸醫內科學、獸醫外科學等碩士點是我國建點最早的臨床學科點之一。該學科現在是“江蘇省重點學科”和“國家重點學科”。在武書連中國大學排行榜和中國研究生教育排行榜中，多次列全國同類學科第一
長期以來，本學科立足學科發展前沿和我國獸醫事業發展的需求，凝練學科方向，拓展研究內容，形成了動物營養免疫學與營養代謝病、動物中毒病與畜產品安全、獸醫外科病理學與實驗外科學、動物生殖與產科疾病、中獸醫學與中西獸醫結合、小動物疾病等六給具有明顯特色的研究生培養方向。圍繞這些方向，在硒與畜禽免疫及抗病力的關系、肉雞腹水綜合征發病機理及防治、新型多功能生物飼料添加劑、新型綠色真菌毒素脫毒劑等的研究上取得了具有國際水平的創新性成果，為我國動物營養代謝病的防控、食品安全和人類健康作出了貢獻，先后制訂了農業行業標準2項、江蘇省地方標準8項，獲省部級技術發明或科技進步獎二等獎。
   本學科現有教職工31名。其中教授10名、副教授或高級獸醫師11名；博士生導師8人，碩士生導師6人；具有博士學位14人；享受國務院政府特殊津貼專家2人，被授予農業部有突出貢獻中青年專家稱號1人，入選江蘇省“333工程”二層次人才1人，江蘇省“青藍工程”優秀青年骨干教師2人。
學科一直把人才培養放在重要位置。我校動物醫學本科專業是江蘇省高等學校品牌專業，教育部特色專業，本學科主要承擔本科生的臨床教學和臨床實踐能力的培養任務，每年培養本科生150人左右。目前本學科在讀學術型碩士生約120名、學術型博士生約30名（含外國博士生6名），在讀專業型碩士和博士生約60名。在教學任務成倍增加的同時，學科注重教學管理，發揮學科優勢，加強臨床實踐，提高教學質量，努力為國家和社會培養合格的獸醫人才。 
學科設有“畜禽營養代謝病研究室”、“小動物疾病研究室”和“中西獸醫結合研究室”3個校級研究室，已形成了“畜禽營養代謝病”、“畜禽中毒病”、“畜禽骨骼生物學”、“小動物疾病”、“生殖生物學與生殖疾病控制”及“中西獸醫結合”等具有鮮明特色的穩定的研究方向。近年來學科先后承擔了國家“973”、“863”、“科技支撐計劃”和“國家自然科學基金”等國家級項目和多項部、省、市科研項目和國際合作項目，年均經費在500萬元左右。每年平均在核心期刊上發表高質量的科研論文50多篇，其中SCI收錄論文20多篇。在畜禽營養代謝病及中毒病、中西獸醫結合、畜禽骨骼與關節疾病及產科病等方面的研究達到了國內領先或國際先進水平。先后獲得部省級科技獎12項，國家發明專利30 多個，國家新獸藥證書2項。
多年來，臨床獸醫學科的教師和職工通過獸醫院及對外服務，及時解決畜牧生產上的實際問題，其服務范圍除覆蓋江蘇全省之外，還輻射北至河南、山東、安徽、河北，東至上海、浙江，南至江西、廣西等省，每年平均診療畜禽病例10000例以上，有效防治畜禽頭數達500萬頭（羽）以上，為我國畜牧業的發展和人類健康作出了重要貢獻。
學科積極開展國際學術交流與合作。近年來，學科先后有近30人次到國外學習進修，攻讀博士學位、考察、合作科研，與美國、日本、加拿大、丹麥、澳大利亞、英國等國的有關學校、研究機構經常進行互訪，國際學術交流十分活躍。近十多年來，每年定期舉辦國際獸醫針灸、中藥培訓班，培養了一大批國外中獸醫人才。
近年來，臨床學科的教學、科研基礎條件獲得了明顯改善，目前已擁有熒光PCR儀、氣相色譜、液相色譜、薄層掃描色譜系統、原子熒光分光光度計、生化分析儀、麻醉呼吸機、麻醉監護儀、硬組織切片機、萬能材料試驗機等高尖端科研儀器，擁有CR攝片系統、B超、血流變分析儀、血球分析儀、尿液分析儀、電動骨科器械等先進的儀器設備，為本學科的進一步發展奠定了堅實的基礎。
與國內外同類學科比較所具有的優勢與特色是：① 學術團隊陣容較為強大，發展較為均衡，每一個三級學科帶頭人都有出國經歷，在國內同行中都有顯著學術影響。② 科研基礎條件較好，獲得科研資助經費較多，發表SCI論文的數量和質量在國內同類學科中具領先地位。③研究生培養的數量和質量得到國內同行公認。④ 獸醫院對外服務成績突出。