20世紀90年代中后期，學校將體育學科納入了學科建設規劃，1996年成立“清華大學體育與健康科學研究中心”。“九五”期間，申請到國家體育總局的“體育社會科學重點研究基地”和清華大學的“運動人體科學重點實驗室”，建立了比較完備的體育科研平臺，學校“985”投入500萬用于體育學科建設。

 

1998年申請到“體育教育訓練學”碩士學位點，2003年又申請到“運動人體科學”和“體育人文社會學”2個碩士學位點和“體育教育訓練學”博士學位點，成為國內第一個申請到體育博士點的普通高校。2009年申請到“體育學”博士后流動站，2010年申請到一級學科。除本學位點外，還與生物醫學工程研究所、人文學院等聯合招收并培養碩士和博士研究生。在2004年教育部學科評估中，排在北京體育大學、上海體育學院、武漢體育學院之后列全國第四位。

 

體育科學研究發揮清華大學多學科綜合優勢，提出“入主流、有特色、高起點、開放性”和“有所為有所不為”的指導方針。

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