理化檢驗系的前身為1989年山東醫科大學衛生系創辦的第一屆衛生檢驗專科，根據學科發展現狀及社會需求，于1994年改為衛生檢驗本科，學制五年，授予醫學學士學位。1998年，教育部將衛生檢驗專業與預防醫學專業合并，成為預防醫學專業衛生檢驗方向。2003年，SARS等重大突發公共衛生事件后，于2004年重新設置衛生檢驗專業，學制四年，授予理學學士學位，包括理化檢驗和微生物檢驗兩個方向。2015年，理化檢驗教研室成立理化檢驗系。 理化檢驗系現有專任教師5人，其中教授3人，講師2人；博士生導師1人，碩士生導師2人，所有教師均為年富力強的中青年。山東大學公共衛生學院理化檢驗專業是山東省衛生檢驗重點實驗室，在學校“985”二期工程和211工程的支持下，先后建設了山東省實驗教學示范中心、山東大學衛生分析測試中心，有原子吸收、熒光分光光度計、氣相色譜、液相色譜、紫外分光光度計、倒置顯微鏡、光學顯微鏡等萬元以上大型儀器設備。