海洋科學與技術學院是我校最早實現本科、研究生多層次教育的教學科研單位。始建于2000年，其前身為我校海洋科學系。十多年來，學院緊密結合國家及地方的海洋戰略，開展海洋科學與技術領域的科學研究與人才培養，取得了跨越式發展。目前學院人才梯隊合理，學科平臺完善，科研力量強勁，主干學科海洋科學在2016年度教育部一級學科評估中排前5名，2019年海洋科學專業入選首批國家級一流本科專業建設點，成為我國海洋科技創新和人才培養的重要支撐力量。
學院現有教職工90余人，其中從事科研教學工作一線教師72人，擁有高級職稱人員46人，占科研教學人員的63%；擁有博士學位教師62人，占科研教學人員的86%。現有雙聘（兼職）院士4人，國家級特聘專家1人，新世紀百千萬人才2人，教育部新世紀優秀人才支持計劃3人，錢江學者特聘教授2人，浙江省“151人才工程”第二層次2人，浙江省本科高校中青年學科帶頭人4人，聘有物理海洋學國際知名教授4人，初步形成了一支梯隊合理、專業素質過硬、技術力量較強的師資隊伍。
學院始終將學科建設、科學研究和人才培養作為學院發展的首要任務。海洋科學是浙江省一流學科A類，學科擁有“國家海洋設施養殖工程技術研究中心”和“海洋生物種質發掘與利用國家地方聯合工程實驗室”2個國家級科研平臺以及“浙江省海水養殖裝備與工程技術重點實驗室”、“浙江省海洋增養殖工程技術研究中心”、“浙江省海洋科技創新服務平臺”和“浙江省海洋生物種質發掘與利用工程實驗室”等4個省級科研平臺，擁有浙江省教育廳“極端海洋過程對海洋生態環境災害的影響”和浙江省科技廳“海水養殖重點科技創新團隊”2個創新團隊，建有“海洋設施養殖工程技術”2011省級協同創新中心，建有1個博士后科研工作點、2個院士工作站。
學院主持“十三五”國家重點研發計劃、國家863計劃、國家科技支撐計劃、國家自然科學基金、重大國際合作計劃項目及課題70余項，其中科技部“十三五”國家重點研發計劃項目1項，國家科技支撐項目2項，國家自然科學基金委重點項目1項，國家自然科學基金委共享航次項目1項；在主要研究領域取得了一批重大成果，獲國家科技進步二等獎1項，省部級一等獎5項、二等獎13項。在海洋動力災害及對生態環境影響、海水養殖設施工程與裝備、海洋生物資源發掘與利用和海洋生態環境修復與治理等領域取得重要突破，在氣候與海平面變化及其影響、深水網箱研發、石首魚科魚類、海洋頭足類育種及增養殖、海域價值評估等研究方向走在國內前沿，形成了顯著的特色方向優勢。
學院下設海洋科學、生物科學、環境科學3個系，擁有海洋科學、海洋技術、生物科學和環境科學與工程4個本科專業，以及海洋科學一級碩士點（包括物理海洋學、海洋化學、海洋生物學和海島開發與保護4個二級碩士點）和設施農業專業碩士點。已實現本、碩雙層次培養，其中海洋科學和生物科學是浙江省重點建設專業，海洋科學專業是國際化試點專業，海洋技術為浙江省優勢專業，上述專業均依托浙江省一流學科A類（海洋科學）學科建設。在本科教學方面獲國家級教學成果二等獎1項，省級教學成果二等獎2項。近十年來，學院先后為社會培養優秀本科畢業生2000多名，碩士畢業生200多名，聯合培養博士研究生10余名。本科和研究生一次性就業率平均達到95%以上，就業專業相關度達到60%以上；本科考研平均錄取率達到30%以上，特別是海洋科學專業考研平均錄取率達到50%左右，且30%以上的學生被雙一流高校錄取，為海洋領域培養了大量優秀人才，為國家和地方海洋經濟戰略的實施提供了重要支撐。此外，學院與意大利比薩大學、俄羅斯國立湖河漁業研究所、日本東京海洋大學、澳大利亞塔斯馬尼亞大學、臺灣海洋大學等30多所境外高校和科研院所建立了長期合作關系，為本學院人才培養的國際化奠定了良好的基礎，浙江海洋大學比薩海洋研究生學院的成立為我院國際化人才培養的拓展和深化提供了重要支撐。本學院已成為我國海洋領域高端人才重要的培養基地。