工業工程系隸屬于浙江理工大學機械與自動控制學院，擁有一支科研和教學素質優秀的師資隊伍，共有教師19人，其中教授3人，副教授5人，博士生導師3人，碩士生導師8人，具有博士學位教師16人，在讀博士學位教師1人，其中浙江省省級特聘教授（錢江學者）1人，浙江省“151”人才第一、二層次3人。
工業工程系擁有“機械制造及其自動化”學術型、“工業工程”全日制專業學位兩個碩士點，承擔“工業工程”本科專業的教學和管理工作。建有物流實驗室、人因工程實驗室、虛擬仿真實驗室等，依托浙江省現代紡織裝配技術省重點實驗室，配置多套先進的儀器設備和大型系統軟件，能夠為研究生、本科生從事相關科學研究和教學工作提供了良好的平臺和基礎。與美國、英國等大學和研究機構建立了良好的合作關系。
工業工程系涉及機械制造及其自動化、工業工程兩個主要研究領域，機械制造及其自動化研究方向包括：(1）數字化設計與制造、先進制造系統；（2）CAD/CAM/CAE；（3）氣固兩向流；（4）特種加工技術；（5）制造業信息化等。工業工程研究方向包括：（1）工作研究（包括時間研究與方法研究）；（2）質量管理與質量控制；（3）設施規劃與物流分析；（4）生產計劃與控制；（5）現代物流與供應鏈管理等。研究內容涉及：工程分析、工作標準、動作研究、時間研究、時間標準、時間價值、價值分析 （VA）、工廠布置、搬運設計等。
近五年來，工業工程系承擔有國家自然科學基金項目、國家“863”計劃項目、國家973預研項目、浙江省科技廳重大科技專項、錢江人才項目、浙江省自然科學基金（含重點項目、杰出青年團隊項目與一般項目）和企業委托橫向課題等20余項，研究總經費達300余萬元。在國內外重要學術刊物和會議上發表學術論文90余篇，其中被SCI/EI/ISTP收錄30余篇，出版專著2部，獲國家軟件著作權登記15項；獲得浙江省科技進步獎一等獎、二等獎各1項。