鄭州大學醫學院創始于1928年的國立中山大學醫科，開啟了河南醫學高等教育的先河。1952年河南醫學院獨立建院，1958年學院遷至鄭州，1984年更名為河南醫科大學。2000年7月與原鄭州大學、鄭州工業大學合并組建新鄭州大學。
2018年10月，學校成立醫學院，醫學院是學校領導下的教育管理綜合單位，代表學校舉辦醫學教育。對醫學教育實行統一領導，進行統籌、規劃、協調和管理，強化醫學教育內部各要素的融合，加強基礎與臨床之間的有機聯系。
所屬的教學院系、教學平臺包括：基礎醫學院、臨床醫學系（臨床醫學、麻醉學、醫學影像學、醫學影像技術）、口腔醫學院、護理與健康學院、醫學檢驗系、兒科醫學系、康復醫學系、臨床技能中心、基礎、臨床實驗教學平臺等。
所屬的科研機構、科研平臺包括：醫學科學院的轉化醫學中心、實驗動物模型中心、學校設置的研究機構等；食管癌防治國家重點實驗室；河南省（鄭州大學）醫藥研究院；實驗動物中心、基礎醫學研究中心。
附屬醫院包括：第一附屬醫院、第二附屬醫院、第三附屬醫院、第五附屬醫院、人民醫院、附屬兒童醫院、華中阜外醫院、附屬腫瘤醫院、附屬鄭州中心醫院、附屬洛陽中心醫院。
現開設有基礎醫學、臨床醫學、兒科學、口腔醫學、醫學檢驗技術、醫學影像學、麻醉學、康復治療學、醫學影像技術9個專業。臨床醫學專業是教育部首批卓越醫生教育培養計劃——“五年制臨床醫學人才培養模式改革”和“臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革”的試點高校，是河南省名牌專業。
現有基礎醫學、臨床醫學、護理學3個一級學科博士點、臨床醫學博士專業學位授權點、6個一級學科碩士學位授權點、3個碩士專業學位授權點、3個博士后科研流動站。臨床醫學為國家一流建設學科，臨床醫學、藥理學與毒理學、生物學與生物化學學科、分子生物學與遺傳學、神經科學與行為學ESI排名全球前1％，其中臨床醫學ESI排名進入全球前1.65‰。擁有省部共建食管癌防治國家重點實驗室、互聯網醫療系統與應用國家工程實驗室、國家遠程醫療中心、國家藥品臨床研究基地、細胞與基因治療、癌癥化學預防國際聯合研究中心等國家級科研平臺。近5年來，醫學學科已承擔國家級科研課題543項，省部級2728項。獲省級以上科技獎勵437項，其中獲國家科技成果二等獎1項；獲得授權專利477項，其中發明專利46項。在《Nature》《Nature Communications》《Gut》《Jama》等高水平期刊發表學術論文多篇。
擁有一支教學、醫療、科研水平較高、結構合理的人才隊伍。其中，高級專業技術人員1387名。教師隊伍中，有院士2人、特聘院士19人、長江學者2人、國家杰青5人、……計劃2人、<>計劃5人、國家級“百千萬人才工程”人選9人、中原學者3人、享受國務院特殊津貼專家58人、享受河南省政府津貼19人。
辦學條件優越，學校在主校區、醫學院校區為醫科辦學配備了良好的物理空間和教學設施。建設有基礎醫學實驗中心、臨床醫學實驗中心和臨床技能訓練中心等三大實驗教學平臺。學校有醫學圖書館12150平方米，館藏圖書20多萬冊，圖書管理手段先進，信息化程度高。
注重大學生創新能力培養，鼓勵本科生參加科研與創新訓練項目。每年有一批大學生創新創業訓練項目得到國家和學校支持，近5年來，共獲得國家級項目130項，省級14項，校級558項。獲美國大學生數學建模競賽二等獎1人。第十二屆“挑戰杯”河南省大學生課外科技學術作品競賽省級二等獎5人。國際大學生ICAN創新創業大賽（國家級）二等獎1人，全國大學生電工數學建模競賽（國家級）二等獎1人。全國大學生英語競賽國家級特等獎5人、一等獎3人、二等獎9人、三等獎31人。河南省第十二屆大學生課外學術科技作品競賽省級一等獎4人。獲全國高等醫學院校大學生臨床技能競賽特等獎1次，一等獎1次，二等獎2次等等。
國際辦學特色鮮明。醫學科學院獲批為首批地方高校國家級“國際化示范學院”，院長尼克·萊蒙當選為中國工程院外籍院士。基礎醫學院是河南省教育國際化示范單位。近年來多批次選派醫學本科學生赴美國短期訪問學習。分別與美國、英國、德國、日本、瑞典、挪威、丹麥、澳大利亞、臺灣等國家和地區的大學、研究所、醫學院、醫院等建立了合作與交流關系。近5年來共有150多名教師赴美國哈佛大學醫學院、加拿大約克大學、芝加哥大學等研修。每年接收臨床醫學專業海外留學生約200多人，共有在校留學生1084人。
九十多年來，鄭州大學醫學院培養了以“感動中國”十大年度人物胡佩蘭教授，我國眼內異物研究的奠基人、全國“十大最美醫生”張效房教授，中國科學院閻錫蘊院士等為代表的4萬余名優秀醫學人才，為中部地區乃至全國的醫療衛生健康事業做出了巨大貢獻。學生培養質量優秀。2018年臨床醫學專業畢業生參加臨床執業醫師資格考試的綜合通過率為86.21%，高出片區13.37個百分點，高出全國11.92個百分點。
10家附屬醫院開放床位數3萬余張，年門診量突破2000萬人（次），現有國家臨床重點專科36個，省級醫學重點（培育）學科139個，有6家醫院分別入選國家疑難病癥診治水平提升工程和國家區域醫療中心創建單位，是河南省醫學創新人才和高端人才培養的主要臨床基地，發揮著重要的引領和示范作用。
展望未來，鄭州大學醫學院將緊緊圍繞健康中國戰略實施，進一步依托學校深厚的文化底蘊和綜合性大學多學科優勢，促進學科交叉融合，突出辦學特色，堅持立德樹人，推進教育教學改革，優化服務生命全周期、健康全過程的醫學專業結構，改革創新，砥礪奮進，建設國內一流、國際知名的醫學院，培養一流醫學人才，服務健康中國建設。