中國農業大學獸醫學科是我國高等院校中最早成立的獸醫學科之一，動物醫學院也是中國農業大學歷史最為悠久的學院之一，有著悠久歷史和深厚積淀，最早可追溯至京師大學堂創辦時期，1902年頒布的《欽定京師大學堂章程》中書有“農業科之目四，一曰農藝學、二曰農業化學、三曰林學、四曰獸醫學”的規定，1903年《奏定大學堂章程》第六節農科大學的各科課程中記載有獸醫學門科目的詳細課程設置。
動物醫學院的歷史足跡始終伴隨著中國農業大學的發展，從京師大學堂農科1914年改名為北京農業專科學校，到1923年改名為國立北平農科大學，再至1928年改為北平大學農學院，各時期的中國農業大學前身都設有獸醫學課程；1947年北方大學農學院在晉冀豫成立，設有畜牧獸醫系和獸醫專科學校，1948年7月北方大學農學院改名為華北大學農學院；1949年10月9日由熊大仕先生創建的北京農業大學獸醫系在北京大學農學院、清華大學農學院和華北大學農學院合并后正式誕生，1984年成立獸醫學院，1993年更名為動物醫學院。
動物醫學院幾遇變遷，歷經坎坷，逐漸發展、壯大起來，特別是獸醫系成立之后，處處體現了黨在各個時期的領導和關懷，始終浸透著老一輩科學家對獸醫事業發展所做出的畢生努力以及廣大教育工作者的智慧和力量。熊大仕教授、孔繁瑤教授、李寶仁教授、蔣金書教授、張中直教授、汪明教授曾先后擔任系主任或院長，張鶴宇、王洪章、羅仲愚、吳學聰、王樹信、申葆和、于船等飲譽海內外的著名教授先后在這里執教。
回顧歷史，我們清醒地看到，隨著社會的發展、進步，人們對獸醫教育的認識有了很大的提高，獸醫的重要作用也越來越凸現出來，我們將秉承“同一個世界、同一個健康”的理念，肩負著“發展獸醫科技、保障人類健康”的院訓，繼續努力奮斗。