福州大學生物科學與工程學院導師：呂暾 正文

　　姓名：呂暾　　
　　性別：男　　
　　職稱：研究員　
　　學院：生物科學與工程學院
　　電子郵件: [email protected]
　　電話: 13338292585
　　　

　　個人簡歷：

　　所受教育
　　物理化學博士 (20002-2007)
　　韋恩州立大學(美國)　　化學系　　　　　計算機工程碩士 (2001-2002)
　　韋恩州立大學(美國)　　計算機工程系　　生物化學碩士 (1996-1999)
　　清華大學　　　　　　　生物系　　　　　生物化學學士 (1991-1996)
　　廈門大學 　　　　　　生物系

　　工作經歷
　　2008-目前　　福州大學生物科學與工程學院 研究員
　　從事功能蛋白工程的研究，目前關注抗體，疫苗，工業用酶

　　2007-2007　　美國韋恩州立大學醫學院 助理研究員
　　研究Melatonin對嗜酸性蛋白過氧化物酶EPO的抑制作用和EPO抑制藥物的初步篩選和設計

　　2002-2007　　美國韋恩州立大學化學系 助理研究員
　　計算化學并行程序的開發

　　2001-2002　　美國密歇根大學技術學院 講師
　　Bioinformatics Certificates 資格考試培訓

　　參與的課題
　　束縛環境下的化學反應機理

　　高性能并行計算集群系統的分布式文件系統開發

　　HIV 蛋白酶點突變與HIV多重抗藥性相關性研究

　　基于距離幾何的水稻金屬硫蛋白三維結構預測方法
 

　　個人簡介：
　　1.技術平臺：
　　1.1 生物大分子模擬：運用分子動力學模擬軟件，對蛋白質、核酸等生物大分子的性質進行研究，探索結構與功能的關系。
　　1.2 計算機輔助蛋白質設計：對蛋白質的氨基酸序列進行設計以提高目標蛋白的性能，例如抗體的親和力，蛋白的熱穩定性。
　　1.3 分子篩選與定向進化系統：主要是噬菌體展示系統，目前利用它來篩選抗體，展示抗原表位。
　　2. 研究領域:
　　2.1 圍繞單個生物大分子的結構與功能展開工作，通過分子的理性設計對藥物蛋白進行改造、修飾，改善藥物蛋白的性能，如高效藥物蛋白的理性設計，藥物蛋白穩定性的提高，篩選、設計新型酶, 功能多肽的設計等。3.2
　　2.2 圍繞生物大分子間最基本的相互作用“分子結合”展開工作，如通過研究抗原-抗體結合開展抗體藥物篩選，病毒中和抗體的篩選，病毒檢測試劑盒的研發，疫苗的設計等應用研究。
　　2.3 生物大分子相互作用系統上，關注蛋白質表達系統，基因表達調控網絡，肝硬化，衰老分子生物學。

　　 承擔科研項目：

　　(1) 2008-2011 校科研啟動基金：抗三聚氰胺單克隆抗體的篩選，犬細小病毒二代疫苗開發，抗體親和力成熟系統構建。

　　(2）2008-2011年主持福建省青年人才創新基金：基于網絡服務模式和GPGPU的生物分子模擬軟件”（項目編號2008F306010107）

　　(3）2007-2008年參與美國NIH基金項目：“Melatonin對嗜酸性蛋白過氧化物酶的作用機理及其抑制藥物的初步篩選和設計”（項目編號R01 HL066367）。

　　(4）2001-2004年參與美國能源部基金項目: “納米尺度下的化學反應動力學”（項目編號 DE-FG02-01ER15212）。

　　(5）2003-2005協助完成國家自然科學基金：“水稻莖部高效表達金屬硫蛋白基因啟動子的鑒定”（項目編號30270753）。

　　(6）1999-2003協助完成國家重點基礎研究專項基金:“光合作用高效光能轉化的機理”（項目編號G1998010100)。

　　教授課程： 生物信息學，計算生物學，系統生物學，儀器分析

　　論文發表

　　1. Isolation and identification of a ScFv Antibody against Melamine from a Rabbit Phage Display Library and its Structural Interpretation, Ailing Huang，Tun Lu，Food Science and Biotechnology，20（6），1699-1704（2011）

　　2. 毒素DON單鏈抗體的同源建模及與DON結合的分子模擬研究, 鄭蓉 呂暾，化學學報，69（23），2882-2888（2011）
　　3.A Comparative Reverse Docking Strategy to Identify Potential Antineoplastic Targets of Tea Funtional Components and Binding Mode, R.Zhen，T.S.Chen，Tun Lu，International Journal of Molecular Science ，12, 5200-5212（2011） 4. 一種采用新的相似性度量方法的共調控基因動態模糊聚類算法, 李小梅，郭紅，呂暾 福大學報, vol39, 2, 198，（2011）
　　5. LU分解和Laplace算法在GPU上的實現, 林江宏，林錦賢，呂暾 計算機應用，v31,3,851，（2011）
　　6. 多核CPU和GPU加速分子動力學模擬的實現， 陳穎，林錦賢，呂暾 計算機應用，v31,3,843，（2011）
　　7. Classical Trajectory Studies of the D + H2 → HD + H Reaction Confined in Carbon Nanotubes: Effects of Collisions with the Nanotube Walls Tun Lu, et al., J. Phys. Chem. C ，114(19),9030-9040 （2010）
　　8. 一株產纖維素酶細菌的篩選，鑒定及產酶條件的優化 呂靜琳，黃愛玲，鄭蓉，李典典，呂暾 生物技術，2009,19(6)
　　9. Classical trajectory studies of the D+H2->DH+H confined in carbon nanotubes: parallel trajectories Lu Tun, et al., J. Phys.Chem. C 2008, 112, 15260-15266 (IF 4.1)
　　10. Analysis of the Mechanism by which Melatonin Inhibits Human Eosinophil Peroxidase. Lu, Tun, et al., British Journal of Pharmacology 2008, 154(6),1308-1317 　　11. Chemical reactivity within carbon nanotubes: a qantum mechanical study of the D+H2->DH+H reaction Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. C 2008, 112. 2654-2659 (IF 4.1) 　　12. 有關阿爾茨海默病抗Aβ蛋白的藥物研究進展 林旭 黃愛玲 洪安輝 呂暾, 海峽藥學, 2008, 20(10), 1
　　13. Quantum States of Hydrogen and Its Isotopes Confined in Single-Walled Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al., J. Phys. Chem. B 2006, 110. 1742-1751 (IF 4.1) 　　14. Recent applications of iterative methods Goldfield, E. M.; He, Y.; Lu, T., et al., Abstracts of Papers, 225th ACS National Meeting 　　15. Aquifex aeolicus Aspartate Transcarbamoylase, an Enzyme Specialized for the Efficient Utilization of Unstable Carbamoyl Phosphate at Elevated Temperature Purcarea, C., Ahuja, A., Lu, T., et. al. J. Bio. Chem. 2003, 278, 52924
　　16. Quantum States of Molecular Hydrogen and Its Isotopes in Single Walled Carbon Nanotube. Lu, Tun, et all, J. Phys. Chem. B 2003,107. 12989-12995 (IF 4.1)
　　17. The Equilibrium Constants for Molecular Hydrogen Adsorption in Carbon Nanotubes. Lu, Tun, et al. J. Theo. Comp. Chem. 2003, Vol. 2. No. 4 621-625 (IF 1.0)
　　18. Modeling rice rgMT as a plant metallothionein-like protein by the distance geometry and homology methods Lu, Tun, et al. Acta Botanica Sinica 2003, 45, 1297 (IF 0.4)
　　19. Modeling the cysteine rich domain of plant metallothionein-like protein. He,H.; Zhu,C., Lu,T., et al. Acta Botanica Sinica 2002, 44(10): 1155-1159
　　20. Prediction for tertiary structure of metallothionein CAP3 from Colletotrichum gloeosporioides He, H.; Lu, Tun; et al. Shengwu Huaxue Yu Shengwu Wuli Jinzhan 2002, 29, 293
　　21. Hiv Protease Multidrug Resistance is Associated with the Loss of Key Contacts between the Protease and the Inhibitor. Kovari, L. C.; Cheng, P; Lu, T. Sitges, Spain 2000.
　　22. Classification and Nomenclature of Plant Metallothioein-like Proteins Based on Their Cysteine Arrangement Patterns Liu, J. Y., Lu, T. Acta Botanica Sinica. 2000, 42(6): 649-652.
　　23. 3D model for Kiwi503 by Distance Geometry and Homology Method. Zhu, C., Lu, T., et al. Chinese Science Bulletin, 2000, V45(6): 602-606.
　　24. Characterization of primary structure of rice ricMT, J. Tsinghua Univ. Lu, Tun, Liu, J. Y., 2000　Vol.40　No.6　P.29-32
　　25. Analysis of salicylic acid induced proteins in rice Shi, S., Pan, M., Lu, T., et al. Tsinghua Sci. and Tech. 1999, 4, 1519
　

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