甘肅農業大學畜牧學學科于2001年被國家人事部 和全國 博士后管理委員會批準設立博士后科研流動站，2003年獲畜牧學一級學科博士學位授權點。畜牧學一級學科為甘肅省重點學科，動物遺傳育種與繁殖學科為農業部重點學科。畜牧學現有動物遺傳育種與繁殖、動物營養與飼料科學、特種經濟動物飼養、動物生產學、動物性食品營養與工程等5個博士（碩士）學位授權點，覆蓋甘肅農業大學的動物科技學院（4個）、食品科學與工程學院（1個）及畜牧系統工程研究所。有甘肅省畜產品工程技術研究中心、甘肅省現代養豬工程技術研究中心、中美草地畜牧業可持續發展研究中心、甘肅省草食動物生物技術重點實驗室、甘肅省農畜產品加工貯藏重點實驗室、甘肅省干酪素工程技術研究中心、甘肅省功能乳品工程實驗室、乳品行業技術中心、甘肅省牛羊基因改良工程實驗室等科研平臺。有動物遺傳學理論與應用；動物育種理論與技術；動物繁殖技術；動物營養生理與產品品質調控；動物營養及飼草料資源的開發利用；淡水經濟動物生物學及養殖；動物生產；動物生物技術研究與應用；動物性食品營養與工程等穩定的研究方向。
多年來，該學科點在反芻動物（綿羊、山羊、奶牛）遺傳特性研究、畜禽及特種經濟動物品種資源保護、豬品種選育和配套系生產、動物營養及其調控機制、乳品科學與技術、牛羊肉品科學與技術等研究領域取得了一批國內領先和國際先進水平的研究成果，許多研究填補了國際和國內研究的空白。
近五年來，畜牧學科承擔國家863計劃、國家科技支撐計劃、國家自然科學基金、科技部境外合作科研項目、農業部國家現代農業產業技術體系項目、公益性行業（農業）科研專項項目、甘肅省科技廳重大項目等111項，獲得國家科技進步二等獎1項、甘肅省科技進步一等獎5項、二等獎3項、省技術發明三等獎1項等各類科研成果獎25項，到位科研經費3946.78萬元。獲專利授權11項；完成地方標準12部；在國內外學術期刊發表論文400余篇，其中SCI論文41篇；主、參編出版全國統編教材及專著和譯著39部。
該學科現有師資54人，其中教授17人、副教授16人。博士生導師17人，碩士生導師38人。有第六屆國務院學科評議組成員1人，甘肅省領軍人才4人，國家現代農業產業技術體系崗位科學家3人，甘肅省特聘科技專家3人，入選甘肅省“333”、“555”人才工程9人，甘肅省“師德標兵”1人。共培 養 博士研究生85人，碩士研究生565人。
學科點擁有專業實驗室面積3500 M²，現有1個校內動物科學訓練中心和1個乳品加工中試車間，有10余個校外教學科研基地。校內擁有儀器設備1261臺（件），儀器設備總值1617.6萬元，其中1萬元以上儀器設備151臺（件），儀器設備總值1170.3萬元。學科點建有圖書資料室，學校圖書館的各種文獻資源均可共享。