中國醫學科學院基礎醫學研究所、北京協和醫學院基礎學院（以下簡稱所院）成立于1978年，其前身為1958年成立的中國醫學科學院實驗醫學研究所和1921年建立的北京協和醫學院基礎醫學系。目前所（院）在職職工374人，其中中國科學院院士3 人，中國工程院院士3 人，國家杰出青年基金獲得者11人，高級職稱專業技術人員126人。所（院）以學科建設為基礎，重視科研發展與人才培養，現有15個學系和一個對國內外開放的醫學分子生物學國家重點實驗室，一個國家級基礎醫學實驗教學示范中心。承擔著科研和教學兩大任務。

        目前承擔著國家重點基礎研究發展計劃（973）、重大科學研究計劃、國家高技術研究發展計劃（863）、科技支撐計劃及國家自然科學基金重大、重點、創新研究群體、杰出青年基金、教育部/外國專家局創新引智計劃等100多項國家級科研項目。“十一五”以來共到位科研經費4.5億元，發表科研論文1800多篇，其中在國際著名的Nat Genet、Science、PNAS、Blood、Circulation、JCI、EMBO J、Cancer Res、Cell Res、Leukemia、Diabetes、Biol Psychiat、Mol Cell Proteomics、Am J Hum Genet、Hepatology、J Hepatol、Circ Res、Nucleic Acids Res、Cell Death and Differentiation、Journal of Molecular Cell Biology、J Neurosci、Small、Trends Endocrin Met、Arterioscl Throm Vas、European Journal of Cancer、Oncogene等雜志上發表了多篇學術論文。“十一五”以來獲得國家技術發明二等獎1項，中華醫學科技二等獎1項、三等獎2項，高等學校科學技術一等獎2項、二等獎1項，北京市科學技術二等獎1項、三等獎1項。

        教學方面承擔著北京協和醫學院八年制醫學本科生和碩、博士研究生的教學任務，是國家首批批準的博士學位和碩士學位授予單位，現有博士生導師55名，碩士生導師32名，在讀研究生400多人，并建立了基礎醫學博士后流動站。生物學（生化及分子生物學、細胞生物學、遺傳學、生物物理學、生理學）和藥學（藥理學）為國家一級重點學科；免疫學和病理-病理生理學為國家二級重點學科；基礎醫學和轉化醫學為北京市重點學科。2012年北京協和醫學院獲得財政部“小規模特色辦學”經費支持，教學實體化邁出重要一步，教育教學改革工作取得很大進展。

        在科技部、衛生計生委的領導和支持下，所（院）建立了先進的實驗技術支撐條件和良好的學術環境。儀器中心擁有最先進的生命科學實驗儀器和設備，通過了“中國實驗室國家認可委員會”審查，獲得國家實驗室認可，可為在分子和細胞水平上進行一系列樣品制備、純化、分析、檢測和鑒定等實驗提供系統的技術支持。細胞資源中心為國內外醫學研究提供規范的細胞株和細胞培養服務，經過十余年的努力，2011年通過科技部、財政部聯合評估，認證成為國家實驗細胞資源共享平臺，獲得穩定經費支持。所（院）還擁有達到SPF級的實驗動物中心，中心建有完善的功能平臺，包括小動物影像設備、小動物代謝實驗系統、顯微注射平臺和行為學平臺。為進一步加強轉化醫學研究，所（院）成立了組織病理中心。中國醫學科學院蛋白質組學研究中心、組織工程研究中心、納米生物醫學聯合研究中心、神經科學中心和系統醫學研究中心也掛靠在所（院）。

        所（院）具有良好的學術交流和合作基礎，在國內外享有較高聲譽和地位，許多專家在國際、國內學術機構擔任重要職務。中國免疫學會、中國生物醫學工程學會、中國解剖學會、中國生化及分子生物學學會醫學生化專業委員會、北京生理科學會、中華醫學會醫學遺傳學會等學術機構掛靠在所（院）。 《基礎醫學與臨床》雜志由所（院）與北京協和醫院合作承辦。

        所（院）充分發揮人才與技術優勢，在（基因、單克隆抗體）診斷試劑、基因工程藥物、中西藥物以及高分子材料等研發方面取得突出進展，并與國內外二十余家企業建立了良好的合作關系。“十一五”以來，已申請發明專利133項，其中PCT國際申請12項，獲得發明專利授權60項。

        所（院）以建設成為具有國際水平的醫學基礎研究機構和國內一流、世界知名的提供醫學精英教育的基礎學院為發展目標，充分發揮全所（院）專家的集體智慧，科學管理、民主決策，同時致力于構建高效的管理體系和規范的工作程序，努力提高管理效率和水平，為實現發展目標提供保障。所（院）將以“嚴謹、博精、創新、奉獻”的精神，為實現發展目標而努力奮斗。

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