2017年溫州醫科大學孫中生教授課題組考研調劑信息

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2017年溫州醫科大學孫中生教授課題組考研調劑信息 正文
溫州醫科大學基因組醫學研究院孫中生(院長)課題組招收碩士研究生調劑生溫州醫科大學基因組醫學研究院孫中生教授(院長)課題組基于國家發展戰略和十三五規劃(“腦科學與類腦研究”,“加速推進基因組學等生物技術大規模應用”),主要利用基因組學、生物信息學、醫學遺傳學、表觀遺傳學、分子生物學等研究手段從事復雜疾病、特別是神經精神類疾病(例如,孤獨癥、智力低下)和癌癥的遺傳學機制研究。本課題組經費充足,已經申請到多個國家級課題,具有各種生物學實驗平臺、生物信息學分析平臺、具有良好的發展前景。科學研究上,本課題組在導師和學生的共同努力下,取得了多項突破性成功:
1、首次發現并報道節律基因PER1和PER2;
2、開發二代測序可視化工具MagicViewer和SplicingViewer,普通電腦可完成大數據可視化;
3、開發MicroRNA在線分析工具,被評為業內最準確的工具之一;
4、通過全外顯子測序鑒定到中國第一個孤獨癥致病基因ANK3;
5、通過高通量測序鑒定肌萎縮側索硬化癥致病基因SOD1;
6、開發了第一款全面的在線的甲基化分析軟件RRBS-Analyser;
7、開發了癲癇相關突變與基因數據庫EpilepsyGene;
8、開發了第一款在線分析新生突變的工具mirTrios;
9、基于新生突變,首先系統分析神經精神疾病的共有基因和通路,并開發NPdenovo數據庫;
10、開發低起始量,單精度的DNA甲基化圖譜的實驗與分析方法MBRidge;
11、開發單細胞DNA甲基化圖譜的實驗與分析方法Q-RRBS;
12、開發第一款RNA結合蛋白調控數據庫RBP-Var;
13、首次使用全基因組測序分析中國自閉癥患者突變圖譜;
14、首次鑒定到多個自閉癥新基因并進行了深入的分子機制研究;
本課題組在Cell, Molecular Psychiatry, PNAS, Nucleic Acids Research, Journal of Molecular Cell Biology, Genetics in Medicine等國際權威雜志。目前本課題組還有多個基因組學,分子生物學、神經科學的文章Science、Nature Genetics、Nature Neuroscience、Molecular Psychiatry、Annals of Neurology等雜志審稿。
調劑名額:
生物信息學、基因組學等方向2-3名,遺傳學、分子生物學等方向1-2名,共計4-5名。
如有意向且符合條件者,請將簡歷發送至郵件[email protected],我們會根據實際情況回復調劑生。
導師介紹:
孫中生教授簡介如下:
博士,研究員,博士生導師,中國遺傳學會表觀遺傳專業委員會主任,HormonesandBehavior雜志編委。1982年北京大學學士;1992年美國德克薩斯A&M大學博士;1993-1998年先后在德克薩斯大學安德生癌癥研究中心放射治療系、貝勒醫學院分子人類遺傳學系做博士后;1998-1999年任路易斯安那州立大學神經科學中心助理教授、主任助理,同時任生物化學和遺傳系助理教授;1999-2005年在美國康奈爾大學任助理教授,威爾醫學院特護醫學實驗室主任;2005-2010年在中國科學院心理研究所行為遺傳學中心任研究員,2010年至今任北京生科院研究員。1997年,榮獲Science雜志十大科學突破,2006年入選中科院“百人計劃”,并入選“新世紀百千萬人才工程”。
http://sourcedb.biols.cas.cn/cn/...130922_3936098.html
學生待遇:
1、每月發放不低于1300元的生活補貼;
2、所有在讀研究生均享受8000-10000元/年的助學金,可抵消全部學費;
3、研究生期間,學生均有自己獨立負責的課題,同時參與、合作課題組其他相關課題;
應聘要求:
1.本次招生重點面對生物信息學、基因組學、遺傳學、分子生物學等專業;
2.同時歡迎有醫學、計算機、數學背景的畢業生;
3.良好的英語閱讀寫作及聽說交流能力;
4.吃苦耐勞,有探索精神,對生命科學研究有濃厚興趣;
5.有計算機操作、編程基礎者或者相關生物實驗經驗者優先;
6.碩士畢業后有意向繼續深造者優先;
7.符合溫州醫科大學碩士研究生招生調劑條件:http://yjsy.wmu.edu.cn/
培養方案:
不用擔心基礎,只要你不荒廢時間,師兄師姐帶你進步。前半年可能在溫州修完所有課程,后面所有學生都有機會到北京中科院學習和工作,進行聯合培養。我們對入學的同學進行集中培訓,包括入門和進階。在培訓方面,我們積累到足夠多的經驗。等打好基礎后,我們根據喜好分配你擅長的任務和課題。天道酬勤,有付出才有收獲。
三年結束后,大致兩條路。
1、繼續讀博:
a)、優秀碩士生可直接進入中科院攻讀博士學位(導師在中科院也招生);
b)、優秀碩士畢業生可推薦進入中南大學、東南大學等其他國內一流大學攻讀博士學位;
2、工作:
我們會讓你在碩士期間得到充分的鍛煉,將生物信息學技術運用到爐火純青的地步,包括但不限于精通shell,R處理數據及作圖,Python和perl分析處理大數據,PHP建站,MySQL建立數據庫,PS等。生物信息工程師目前的薪資,可以自己查。我們實驗室出去的學生的月薪一萬起步。
學術成果:
2017年:
Yan Wang, Huijie Liu, Zhongsheng Sun.Lamarck rises from his grave: parental environment-induced epigenetic inheritance in model organisms and humans.Biological Reviews , 2017.
Zhuang Miao, Fengbiao Mao ,Moshe Szyf,Yan Wang,Zhong Sheng Sun Anxiety-Related Behaviours Associated with microRNA-206-3p and BDNF Expression in Pregnant Female Mice Following Psychological Social Stress. Molecular Neurobiology, 2017.(IF= 5.397)
2016年:
Jianing Zhong, Xianfeng Li, Wanshi Cai, Shanshan Dong, Jie Yang, Jian 'an Zhang, Nana Wu, Yuanyuan Li, Mao Fengbiao, Cheng Zeng, Jinyu Wu, Xingzhi Xu, Zhongsheng Sun.TET1 modulates H4K16 acetylation by controlling auto-acetylation of hMOF to affect gene regulation and DNA repair function.Nucleic Acids Research ,2016.(IF= 9.202)
Weiping Tian, Jiesi Wang, Ke Zhang, Huajing Teng, Chong Li, Moshe Szyf, Zhong Sheng Sun & Mei Zhao. Demethylation of c-MYB binding site mediates upregulation of Bdnf IV in cocaine-conditioned place preference OPEN. Scientific Reports, 2016. (IF=5.578)
Fengbiao Mao, Luoyuan Xiao, Xianfeng Li, Jialong Liang, Huajing Teng, Wanshi Cai, and Zhong Sheng Sun. RBP-Var: a database of functional variants involved in regulation mediated by RNA-binding proteins. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2016. (IF= 9.202)
2015年:
Li JC, Cai T, Jiang Y, Chen HQ, He X, Chen C, Li XF, Shao QZ, Ran X, Li ZS, Xia K, Liu CY, Sun ZS, Wu JY. Genes with de novo mutations are shared by four neuropsychiatric disorders discovered from NPdenovo database. Molecular Psychiatry, 2015. (IF=15.147)
Wanshi Cai , Fengbiao Mao , Huajing Teng, Tao Cai, Fangqing Zhao, Jinyu Wu and Zhong Sheng Sun. MBRidge An accurate and cost-effective method for profiling DNA methylome at single-base resolution. Journal of Moleucular Cell Biology, 2015. (IF=6.771)
Kangli Wanga, Xianfeng Libc, Shanshan Donga, Jialong Liangbd, Fengbiao Maobd, Cheng Zengb, Honghu Wua, Jinyu Wuab, Wanshi Caib & Zhong Sheng Sunab. Q-RRBS A quantitative reduced representation bisulfite sequencing method for single-cell methylome analyses. Epigenetics, 2015. (IF=4.780)
2014年:
Yan Wang, Guiling Li, Fengbiao Mao, Xianfeng Li, Qi Liu, Lin Chen, Lu Lv, Xin Wang, Jinyu Wu, Wei Dai, Guan Wang, Enfeng Zhao, Kai-Fu Tang and Zhong Sheng Sun. Ras-induced Epigenetic Inactivation of the RRAD Ras-related Associated with Diabetes Gene Promotes Glucose Uptake in a Human Ovarian Cancer Model. JURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2014. (IF=4.573)
Qing Xie , Qi Liu , Fengbiao Mao, Wanshi Cai, Honghu Wu, Mingcong You, Zhen Wang, Bingyu Chen, Zhong Sheng Sun , Jinyu Wu . A Bayesian Framework to Identify Methylcytosines from High-Throughput Bisulfite Sequencing Data. PLOS Computational Biology, 2014. (IF=4.620)
Xia Ran, Jinchen Li, Qianzhi Shao, Huiqian Chen, Zhongdong Lin, Zhong Sheng Sun and Jinyu Wu. EpilepsyGene: a genetic resource for genes and mutations related to epilepsy. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2014. (IF=9.112)
2013年:
Jinyu Wu, Qi Liu, Xin Wang, Jiayong Zheng, Tao Wang, Mingcong You, Zhong Sheng Sun &Qinghua Shi. mirTools 2.0 for non-coding RNA discovery profiling and functional annotation based on high-throughput sequencing. RNA Biology, 2013. (IF=4.974)
Tao Wang, Qi Liu, Xianfeng Li, Xiaobing Wang, Jinchen Li, Xiaochun Zhu, Zhong Sheng Sun, Jinyu Wu. RRBS-Analyser A Comprehensive Web Server for Reduced Representation Bisulfite Sequencing Data Analysis. HUMAN MUTATION, 2013. (IF=5.144)
Zhanjun Wang, Wanshi Cai, Fang Cui, Tao Cai, Zhaohui Chen, Fengbiao Mao, Huajing Teng, Lin Chen, Jiesi Wang, Zhongsheng Sun, Xusheng Huang, Ping Yu. Identification of a novel missense C7W mutation of SOD1 in a large familial amyotrophic lateral sclerosis pedigree. NEUROBIOLOGY OF AGING, 2013. (IF=5.013)
Yongqing Wang1, Yan Wang1, Qi Liu, Gang Xu, Fengbiao Mao, Tingting Qin, Huajing Teng, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Zhong Sheng Sun, Congying Xie. Comparative RNA-Seq analysis reveals potential mechanisms mediating the conversion to androgen independence in an LNCaP progression cell model. CANCER LETTERS, 2013. (IF=5.621)
2012年:
Cheng Bi, Jinyu Wu, Tao Jiang, Qi Liu, Wanshi Cai, Ping Yu, Tao Cai, Mei Zhao, Yong-hui Jiang, and Zhong Sheng Sun.Mutations of ANK3 identified by exome sequencing are associated with Autism susceptibility. HUMAN MUTATION, 2012. (IF=5.144)
Jinyu Wu, Enjian Shen, Dashuang Shi, ZhongSheng Sun & Tao Cai. Identification of a novel Cys146X mutation of SOD1 in familial amyotrophic lateral sclerosis by whole-exome sequencing. GENETICS IN MEDICINE 2012. (IF=7.329)
2011年:
Jianmin Wu1, Gang Wu, Lu Lv, Yong-Feng Ren, Xue-Jiao Zhang, Yong-Feng Xue, Guiling Li, Xincheng Lu, ZhongSheng Sun and Kai-Fu Tang. MicroRNA-34a inhibits migration and invasion of colon cancer cells via targeting to Fra-1. CARCINOGENESIS, 2011. (IF=5.334)
2010年:
Huabin Hou, Fangqing Zhao, LingLin Zhou, Erle Zhu, Huajing Teng, Xiaokun Li, Qiyu Bao, Jinyu Wu and Zhongsheng Sun. MagicViewer Integrated solution for next-generation sequencing data visualization and genetic variation detection and annotation. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)
Erle Zhu, Fangqing Zhao, Gang Xu, Huabin Hou, LingLin Zhou, Xiaokun Li, Zhongsheng Sun and Jinyu Wu. MirTools MicroRNA profiling and discovery based on high-throughput sequencing. NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2010. (IF=9.112)
溫州醫科大學基因組醫學研究院
2017年3月17日
溫州醫科大學
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