云南大學外國語學院日語系成立于1988年7月，是云南省最早建立的高校日語專業，至今已有30年的專業辦學歷史。2012年，日語系經過26年本科人才培養的歷練及教學資源的積累，設置了日語語言文學碩士學位授權點。2018年1月，云南大學“小語種與外國語言文學學科建設項目”被首批列為云南大學“雙一流”建設重點項目之一，日語專業為其中的建設專業之一。
日語系現有教師8人，其中教授1人，副教授4人，講師3人。所有教師均具有碩士及以上學位，均有在日留學、進修學習的經歷。日語系還常年聘用日籍教師1至2人。目前有一位教師擔任2018—2022年云南省高等學校日語專業教學指導委員會主任委員，一名教師擔任中國日語教學研究會理事，同時兼任中國日語教學研究會西南分會副會長，兩名教師任云南省翻譯協會理事。師資隊伍良好的學術背景、合理的學術結構為日語專業培養高質量、高素質的日語人才提供了有力的保障。
日語系本科開設了特色鮮明的語言基礎課程和人文素質課程，包括“高級日語”、“日語寫作”、“日漢翻譯”、“跨文化交際”、“日本社會與文化”、“日本國家概況”、“商務日語”、“第二外語”等。日語系本科階段的培養目標為：通過四年的專業學習，掌握日語及相關的日本文化知識，能熟練應用日語進行口譯和筆譯工作，能閱讀日文原版的報刊書籍，能用日語撰寫研究計劃、畢業論文等。
日語系的碩士研究生有四個研究方向：日本文學研究、語言研究、區域與國別研究、比較文學與跨文化研究。開設的課程有“日本文化史”、“日本文學史”、“日語語言學”、“日本文學思潮及流派研究”、“地緣政治與中日關系”、“中日文化比較研究”等。
日語系積極開展與國內外高校的學術交流及合作。國內主要與山東大學威海分校進行本科層面的合作交流。學生從大一下學期開始，可以申請到山東大學威海分校交換學習一年，所修學分回本校后可以互換。日語系還與日本三重大學、東京經濟大學、大妻女子大學等高校進行學術交流和短期交換留學。與這三所日本大學的交流拓展到研究生層面，日語系在校的本科生及研究生均有機會到日本進行為期半年左右的短期留學，所修學分可以與本校學分互換。除這三所日本大學外，日語系將進一步拓展與日本其他大學的合作交流，為學生創建更多的交流學習的平臺。
日語系學生日語語言基礎扎實，在歷年的全國日語專業四、八級考試中均取得優異成績。每年的考試成績均高出全國平均成績大約20%，有部分學生的成績達到了“優秀”等次。日語系已成功舉辦了四屆“彩云基金日語演講大賽”，學生在大賽中獲得了并列第一、第二名的好成績。在“中華杯全國日語演講比賽西南預賽”中分別獲得過第一、第二、第三名的成績。
日語系設立30年來，為云南省以及西南地區培養了大量社會急需的日語人才。日語專業畢業生有的在國內或日本繼續深造，有的就職于國家機關、高校、外事、旅游、企業等部門。近三年來，日語系平均每年有本科畢業生25名左右，碩士研究生畢業生5名左右，本科和碩士研究生的就業率均為100%。