中藥大生命科學與技術學院導師：方慧生 正文

　　方慧生，1989、1992年于中國人民解放軍第二軍醫大學分別獲學士、碩士，1995年于中國藥科大學獲博士學位。2000年至2002年在瑞典斯得哥爾摩大學斯得哥爾生物信息學中心從事博士后研究。爾后分別為上海生物信息技術研究中心和上海藥物研究所藥物發現與設計中心客座研究員。2005年至今為中國藥科大學教授。1996年獲國家技術發明三獎（第二作者），2002年12月在美國召開的CASP5會議上，在導師Arne Elofsson指導下建立的Pcons2，及與其他人合作的Pmodeller被評為最佳預測方法之一。 并在大會上作介紹（兩個專家預測方法之一）

　　講授課程（學生層次）
　　生物信息學（本科生）、藥物生物信息學（碩士生），后基因組信息學與藥學研究（博士生）、生物信息學軟件操作（博士生）

　　研究方向
　　1. 高質量遠距離同源蛋白序列比較研究
　　2. 基于蛋白質二級結構預測的高質量蛋白質預測模型研究
　　3. 基于多重序列比對的高質量蛋白質預測模型識別研究
　　4. 蛋白質結構柔性研究
　　5. 基于正則分析的蛋白質運動研究
　　6. 蛋白質-DNA連接研究
　　7. 蛋白質代謝網絡研究

　　已發表文章：
　　1. Li J and Fang HS Substitution Transformation of Score Matrix for Improving Alignment Quality of Local Sequence of Distantly Related Proteins, Current Bioinformatics,2012,7,35-42
　　2.  Wallner, B., Fang, H., Ohlson, T., Frey-Skott, J. and Elofsson, A. (2004) Using evolutionary information for the query and target improves fold recognition. Proteins 54 (2) : 342-350. , Impact Factor: 3.354
　　3. Wallner,B, Fang HS and Elofsson A, Automatic Consensus-Based Fold Recognition Using Pcons,ProQ, and Pmodeller, PROTEINS,2003, 53:534–541 (2003) , Impact Factor: 3.354
　　4. Fang, H., Wallner, B. Lundström, J., von Wowern, C. and Elofsson, A. (2001) Improved fold recognition by using the Pcons consensus approach Chapter in “Protein structure prediction:Bioinformatic approach” IUL biotechnology Series, La Jolla, 1: 397-41. , Impact Factor: 2.269
　　5 方慧生等。遺忘因子法在多組分體系分析中的應用，高等學校化學學報, 1994,15:518
　　6 方慧生等。遺忘因子法與其它計算方法在分光光度法中的應用研究，分析化學,1994,22:285
　　7 方慧生等。穩健Madaline網絡算法及其在復方制劑分析中的應用，分析化學,1999,27:266
　　8 方慧生等。Madaline網絡分離重疊光譜峰及其在多組分同時分析中的應用 分析化學，1999,27:14
　　9 方慧生等。Madaline網絡分離重疊光譜峰在來色體系分析中的的應用研究 分析化學，1999,27:875
　　10 方慧生等。序列搜索算法在蛋白質及多肽質解譜解析中的應用，生物化學與生物物理學進展,1995,22:361
　　11方慧生等。多組分同時分析中單個組分的誤差傳遞原理,中國藥科大學學報 1997,29:362
　　12方慧生等。分支定界法在計算機輔助質譜解析蛋白質序列分析中的應用，中國藥科大學學報，1994,25:177
　　13方慧生等。質譜在蛋白質及多肽氨基酸序列分析中的應用，藥學進展， 1993,17:196
　　14方慧生等。改進Madaline學習算法預測蛋白質二級結構，中國藥科大學學報，1996,27:366
　　15方慧生等。人工神經網絡在蛋白質二級結構預測中的應用，藥學進展， 1996,20:7
　　16方慧生等。褶合光譜比值法在未知背景干擾樣品分析中的應用，藥物學研究與展望，1999,194
　　17方慧生等。基于PCR的Madaline網絡算法及其在分解嚴重重疊光譜峰中的應用，計算機與應用化學，2000,17:96
　　18方慧生等。光譜比值技術在未知背景干擾樣品分析中的應用,計算機與應用化學，2000,17:121
　　19方慧生等。基于Kalman濾波法的Madaline網絡算法及其在部分未知背景干擾樣品分析中的應用,計算機與應用化學, 2000,17:122
　　20方慧生等。EME聯立方程組法在多組分分析中的應用，光譜儀器與分析，1997,19
　　21方慧生等。復雜混合物不分離分析分析研究灰色體系的光譜學方法，光譜儀器與分析
　　22 方慧生等。蛋白質天然構象預測研究進展，學，2005，36:195
　　23 方慧生等。基于折疊識別法的蛋白質天然構象的一致性預測法Pcons2與聚類分析的理論探討，中國藥科大學學報，2006,37:77
　　24 徐建平，方慧生，相秉仁。一種快速比較蛋白質結構預測模型相似性的方法，中國藥科大學學報，2006，37:281待刊
　　25 徐建平，方慧生，相秉仁。基于常用得分矩陣的神經網絡法預測蛋白質二級結構性能的考察，中國藥科大學學報，2006，37：470
　　26 彭敏,方慧生。酶功能分類與序列相似性研究進展。國外醫學藥學分冊,2006, 33(6): 452-455

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