音樂教育系前身為原杭州師范大學音樂學院音教系（設立于1982年），是浙江省開展高等音樂教育歷史最悠久的教學單位。2014年劃歸浙江音樂學院（籌）后，具有了更廣闊的發展空間，進入了新的發展時期。
音樂教育系現有全日制在校本科生686人，專職教師45人。教師中擁有正高級職稱2人，副高級職稱14人，博士6人，碩士21人。下轄音樂學（師范）、藝術教育（師范）2個專業。
2002年，音樂學（師范）專業被浙江省教育廳確立為浙江省音樂學科唯一重點專業；2007年音樂學（師范）專業被教育部列為全國音樂學專業課程改革試點單位，同年，被遴選為全國一類特色專業；2015年被列為學校實施課堂教學模式改革計劃試點單位。下設聲樂、鋼琴、音樂理論、藝術實踐4個教研室以及藝術教育研究所和MTC學生藝術團。
全系師生在教學、科研、藝術實踐中取得多項成果，其中在研國家藝術基金資助項目1項，教育部人文社會科學研究青年項目1項，省部級課題多項；曾榮獲省部級以上各類科研成果獎10余項。學生連續兩屆獲得全國高校音樂學（師范類）專業本科學生基本功比賽團體一等獎，連續3屆獲得浙江省高等學校師范生教學技能競賽一等獎；在浙江省音樂舞蹈節、浙江省大學生藝術展演活動、浙江省大學生藝術節等國內外各級音樂舞蹈比賽中均獲得重要獎項。
音樂教育系始終堅持把為中小學培養優秀師資作為人才培養的中心，正繼承優良傳統，立足時代要求，不斷改革創新，激發全系師生工作熱情，努力提升教學質量、人才培養質量以及藝術實踐水平，爭取成為國內音樂教育領域具有引領性和重要影響力的教學系部。

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