2002年貴州財經學院進行院系調整，撤銷了投資系，除部分教師調整到會計系創辦財務管理專業外，在投資系原有辦學力量基礎上成立了管理科學系，有“管理科學”、“工程管理”、“農村區域管理”等三個專業。2005年學校又在管理科學系的基礎上成立管理科學學院，保留原有的“管理科學”、“工程管理”專業，還重新開辦了“房地產經營管理”本科專業并于當年開始招生。2013年房地產經營管理專業改名為“房地產開發與管理”專業。

到目前為止，工程管理系包含三個專業：工程管理、工程造價、房地產開發與管理。其中，工程管理專業是國家重點學科。工程管理系設有房地產研究院，具有一支良好的研究團隊。

在國際合作交流方面，現有ISEC工程管理專業；中外合作辦學——房地產市場營銷專業。

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