藥學專業是藥學院最早建立的專業。1999年開始招收第一屆藥學專業學生，畢業生分布在我國醫院、藥廠、科研單位。  

 培養目標：培養基礎扎實、具備藥學學科基本理論、基本知識和實驗技能知識面廣、具有創新精神，能從事化學藥物、生物技術藥物和天然藥物的研究開發、教育以及藥品質量控制，臨床藥學，醫藥營銷，醫藥企業管理等方面工作的寬口徑、復合型高素質藥學人才。    

主要課程：醫用物理學、系統解剖學、人體生理學、醫學微生物與免疫學、無機化學、有機化學、生物化學、分析化學、藥理學、藥學統計學、物理化學、藥用植物學與生藥學、藥物化學、藥劑學、藥物分析、天然藥物化學、生物藥劑學與藥物動力學、藥事管理學等。

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