日語(yǔ)系與深圳大學(xué)這所特區(qū)窗口大學(xué)共同成長(zhǎng)，1983年開(kāi)始面向全校的日語(yǔ)教學(xué)，1995年正式建系，每年招收本科生40-50名。2012年設(shè)立碩士點(diǎn)，每年招收日語(yǔ)語(yǔ)言、文學(xué)文化、日語(yǔ)教育三個(gè)研究方向6-8名學(xué)生。現(xiàn)有專(zhuān)任教師13名，其中有博士學(xué)位的教師10名。

本系實(shí)施“零起點(diǎn)”教學(xué)，采取“語(yǔ)言技能+專(zhuān)業(yè)方向”培養(yǎng)模式，注重“聽(tīng)說(shuō)讀寫(xiě)”基本功的學(xué)習(xí)與訓(xùn)練，培養(yǎng)實(shí)用型人才。同時(shí)注重人文修養(yǎng)的熏陶，高年級(jí)輔助開(kāi)設(shè)日語(yǔ)語(yǔ)言學(xué)基礎(chǔ)、日本文學(xué)文化概論、日本文學(xué)經(jīng)典選讀、日本歷史、日本哲學(xué)思想等專(zhuān)業(yè)課程，豐富學(xué)生的知識(shí)結(jié)構(gòu)，培養(yǎng)學(xué)生思考能力和學(xué)術(shù)研究意識(shí)。

本系與明治大學(xué)、立命館大學(xué)、大阪大學(xué)、神奈川大學(xué)、早稻田大學(xué)等多所日本名校建立了友好交流，每年派遣交換留學(xué)生公費(fèi)或自費(fèi)赴日留學(xué)，并與札幌大學(xué)合作建立了2+2雙學(xué)位雙校園培養(yǎng)項(xiàng)目，為學(xué)生提供多種留學(xué)深造途徑。

2016年6月本系成立外國(guó)語(yǔ)學(xué)院東亞研究中心。中心立足深圳，服務(wù)地區(qū)，放眼東亞與世界，運(yùn)用文學(xué)、歷史學(xué)、哲學(xué)等人文社科研究方法，摸索東亞社會(huì)文化的總體特征，探尋其文化流動(dòng)與發(fā)展的內(nèi)在文化機(jī)理，探索新時(shí)期東亞研究的新路徑。每年邀請(qǐng)海內(nèi)外知名學(xué)者和青年學(xué)人進(jìn)行學(xué)術(shù)交流，建立廣泛的學(xué)術(shù)合作研究。