生物物理是 生命學科的主干學科之一。 西安交通大學生物物理學科點于 2000 年獲得碩士學位授予權， 2003 年獲得博士學位授予權。它主要以生命科學與技術學院的五個研究所（包括 生物醫學工程研究所、分離科學研究所、癌癥研究所、生物醫學工程與儀器研究所、生物科學與工程研究所 ）為依托，同時也隸屬于現代醫學電子技術與儀器國家專業實驗室、 生物醫學信息工程教育部重點實驗室、 生物醫學工程陜西省重點實驗室。另外，它還借助于生物醫學光子學教育部網上合作研究中心西安交通大學分部 這一平臺進行研究、交流和合作。
生物物理學科的發展目標是緊密結合生命學科的發展，以生命科學前沿和核心領域的科學研究為龍頭，以分子光子學、生物學、生物信息學三大學科的建設為主線，發揮各學科綜合優勢， 培養德、智、體全面發展的高層次專門人才 ，建設具有交大特色的生物物理學科點。
目前，生物物理專業主要有以下研究方向：光生物物理學及分子光子學、腫瘤免疫蛋白組學與生物信息學、細胞分子解剖學、生物微系統、波動能量生物效應與分子成像、生物大分子的分離與檢測等。該專業畢業生擁有深厚的生物物理學基礎知識和專業知識，具有應用理工科專業知識解決生命科學中許多問題的能力。