口腔醫學院成立于2002年，是廣西高等學校優勢特色專業建設點，2013年獲口腔醫學專業碩士學位授權點。設有口腔內科、口腔修復、口腔頜面外科學、口腔正畸學四個教研室，擁有口腔實驗室1個。所在的附屬醫院是國家第一批住院醫師規范化培訓基地，口腔全科及口腔頜面外科被認定為住院醫師規范化培訓專業學科。現有教師27人，其中教授3人、副教授7人、碩士10人，在校生273人。口腔醫學院全體教職工勤政廉政，團結一致，努力工作，2016年獲學校落實黨風廉政建設責任制先進集體、學校教育教學先進集體。教師教研能力強，教師參加全國口腔醫學院校青年教師授課技能比賽獲得三等獎一項；全國醫學（醫藥）院校青年教師教學基本功比賽三等獎1項；全區青年教師教學競賽三等獎1項。近年來，獲各類教、科研項目20多項；獲廣西高等教育教學成果二等獎1項；廣西高等教育教學軟件大賽一等獎1項、二等獎2項、優秀獎1項；廣西高等教育教學軟件應用大賽微課類教學比賽二等獎1項。獲廣西醫藥衛生適宜技術推廣獎2項、百色市科技成果二等獎1項，SCI收錄論文2篇。創立了獨具特色的大學生社會實踐平臺，提高學生的創新創業能力和綜合素質，目前已與多家企業、民營醫院設立簽訂優秀學生獎學金制度及校外大學生社會實踐基地。近幾年，口腔執業醫師考試一次性通過率達80%以上，畢業生就業率達100%，連續三年被學校評為畢業生就業工作先進集體。

口腔醫學院秉承學校“大醫精誠”的校訓，注重培養精醫術、懂人文、有理想、能創新的高質量應用型的口腔醫學專業醫學人才。