云南農業大學機電工程學院創建于1972年，原為農機系，1993年更名為工程技術學院，2014年更名為機電工程學院。
學院擁有農業工程一級學科碩土點，設有農業機械化工程、農業電氣化與自動化、農業生物環境與能源工程和機械設計與制造4個二級學科碩士點（學術學位）以及農業工程與信息技術（專業學位）碩士點。學院現設六個系：農業機械工程系、機械工程系、電氣工程系、工業工程系、車輛工程系和能源與動力工程系；學院有農業機械化及其自動化、機械設計制造及其自動化、電氣工程及其自動化、工業工程、車輛工程、能源與動力工程和機械電子工程七個本科專業，其中：農業機械化及其自動化和機械設計制造及其自動化專業入選省級一流專業建設計劃，農業機械化及其自動化專業為省級特色專業并列為國家級、省級卓越工程師培養計劃專業，機械設計制造及其自動化專業為省級卓越工程師培養計劃專業；《農業機械學》、《汽車構造》和《拖拉機汽車學》等課程為省級精品課程和省級雙語示范課程。學院擁有機電工程實驗教學中心（下設32個專業實驗室）、機械制造實訓中心、農業機械陳列館和機械設計研究所等實驗實踐教學機構。此外，學院實踐教學可利用學校的基礎實驗教學中心、工科專業基礎實驗教學中心等校級實驗中心，在校外建立了14個實踐教學基地。
學院現有教師64人，其中正高級職稱9人、博士學位13人，云南省萬人計劃“產業技術領軍人才1人，云南省技術創新人才2人，云南省高校教師講課比賽特等獎1人。教師共主持國家級自然科學基金6項，云南省科技廳基金項目25項，教育廳科學研究基金40余項，服務于云南省農業、機械行業等橫向課題60余項。教師在《Energy》、《Biosystems Engineering》、《Transactions of the ASABE》、《農業工程學報》、《農業機械學報》等國內外核心期刊上發表論文400多篇，其中50多篇被SCI、EI、CPCI收錄；獲國家專利授權100多項。教師獲得云南省技術發明一等獎（排名第一）1項、云南省自然科學獎三等獎（排名第一）1項等7項省部級科研獎勵。
學院現有在校本科生1668人，研究生86人。學院始終把人才培養作為第一要務，注重學生動手能力和創新能力的培養，加強學生校內外實習、實驗和生產實踐，支持和鼓勵學生參與教師科研項目，參加全國和全省各種競賽，畢業生廣受用人單位好評，就業好。