東莞理工學院1992年成立時開設電子技術與微機應用專業（專科）；1993年開設計算機應用專業（專科）；2000年成立計算機科學與技術系；2002年設置本科專業——計算機科學與技術（學校首批本科專業）；2003年設置本科專業——軟件工程；2004年聯合高等數學教研室和計算中心成立軟件學院，是廣東省首批示范性軟件學院之一。2006年通過了首批學士學位授予專業評審，2008年更名為計算機學院，同年增設了本科專業——信息與計算科學。2016年、2017年分別增設網絡工程、物聯網工程專業。2016年改名為計算機與網絡安全學院。2018年改名為計算機科學與技術學院，下設計算機科學與技術專業、物聯網工程專業、數據科學與大數據技術專業和信息與計算科學專業，擁有計算機科學與技術一級學科碩士點；計算機科學與技術專業進入省一流專業建設點。
學院目前設有計算機科學與技術系、公共教學部和計算機科學與技術實驗教學中心，包括軟件開發課程組、計算數學課程組、系統與網絡課程組、大數據與人工智能課程組、公共計算機課程組、高等數學課程組和工程數學課程組等七個課程組。在校本科生1100余人。
學院師資力量雄厚，現有教職工108人，其中教授16人，副教授36人，具有博士學位53人，IEEE Fellow 1人，享受國務院特殊津貼專家1人，“千百十人才工程”國家級培養對象1人、省級培養對象2人。
學院學科建設成果卓越，計算機應用技術為廣東省重點特色學科；根據艾瑞深中國校友會網發布，2019年計算機科學與技術學科在全國排名53位，位次排名前18%，是我校在全國位次排名最高的學科。
學院擁有省級工程技術中心4個，廣東高校科技創新團隊、東莞市科技創新團隊各1個，東莞市重點實驗室3個。學院承擔了大量國家、省、市科研項目，到賬科研經費超過1億元，以第一單位獲得廣東省科技進步二等獎1項、東莞市科技進步一等獎4項。
學院擁有完善的實驗設備和優越的實驗環境，是計算機科學與技術廣東省實驗教學示范中心。
學院堅持開門辦專業，因材施教，致力培養學生工程能力、創新能力和就業競爭力，以校企深度合作為特色，與華為技術有限公司合作建有華為信息與網絡技術學院。通過合作共建實驗室、引入華為培訓和課程體系創新人才培養模式，提升服務支撐產業能力。截至2018年10月，東莞理工學院華為信息與網絡技術學院師資培訓和學生考證通過率位列全球第一。